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基于GEO数据库的胃肠上皮化生相关基因与通路的生物信息学分析  期刊论文  

  • 编号:
    53cd8025-5617-492e-ae64-d362c69b2d94
  • 作者:
    宋尚晋;顾尤;王怡超;岳小强;
  • 地址:
    海军军医大学附属长征医院中医科;上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院针灸科;上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院脊柱科;
  • 语种:
    中文
  • 期刊:
    肿瘤防治研究 ISSN:1000-8578 2018 年 45 卷 10 期 (768 - 774) ; 2018/10/25 0:00:00
  • 收录:
  • 关键词:
  • 摘要:

    目的挖掘胃黏膜肠化过程中的差异基因、探索其发病机制并验证差异基因是否在胃癌发生过程中持续发挥作用。方法在美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库中检索正常胃黏膜肠化表达谱芯片,并通过GEO2R分析得到差异基因,以及在不同芯片数据中均差异表达的关键基因。将差异基因利用生物学信息注释数据库DAVID进行GO生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,探索正常胃组织向肠化转变的相关生物学通路。并通过TCGA数据库分析关键基因在胃癌组织中的差异变化,通过KM plotter分析关键基因与胃癌患者预后的关系。结果检索到3个涉及正常胃黏膜组织发生肠化有关基因芯片,通过差异分析得到在肠化中差异表达的...

  • 推荐引用方式
    GB/T 7714:
    宋尚晋,顾尤,王怡超, 等. 基于GEO数据库的胃肠上皮化生相关基因与通路的生物信息学分析 [J].肿瘤防治研究,2018,45(10):768-774.
  • APA:
    宋尚晋,顾尤,王怡超,岳小强.(2018).基于GEO数据库的胃肠上皮化生相关基因与通路的生物信息学分析 .肿瘤防治研究,45(10):768-774.
  • MLA:
    宋尚晋, et al. "基于GEO数据库的胃肠上皮化生相关基因与通路的生物信息学分析" .肿瘤防治研究 45,10(2018):768-774.
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