本发明涉及麦冬皂苷肠溶微球制剂及制备方法。该肠溶微球制剂的重量百分比配方组成为麦冬总皂苷提取物5-20%,高分子囊材20-40%,抗黏剂20-40%和增塑剂10-30%。本发明制剂解决了现有麦冬皂苷制剂存在的问题,改善了患者用药顺应性,降低了胃黏膜刺激性,实现了定向给药。